Одной из приоритетных задач UNESP на сегодняшний день является интернационализация вуза за счёт развития сетевого взаимодействия и повышения мобильности аспирантов. В настоящее время действуют две крупные стипендиальные программы - федеральная PRINT (пришедшая на смену проекту «Наука без границ») и SPRINT со стороны штата Сан-Паулу, в которые коллеги приглашают и Южный федеральный университет.